Index _ | A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z _ __absorber_present (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) __available_priors (petitRADTRANS.retrieval.parameter.RetrievalParameter attribute) __build_cia_aliases_dict() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) __check_anisotropic_cloud_scattering() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __check_input_data_file_existence() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __check_line_opacity_mode() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __check_model_functions_map() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) __check_model_parameters_relevance() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) __check_none_model_parameters() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) __check_path_input_data() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __check_pressures() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __check_return_clear_spectrum_relevance() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __check_wavelength_boundaries() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __cloud_color (in module petitRADTRANS.plotlib.style) __clouds_have_effect() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) __compute_additional_continuum_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __compute_cloud_continuum_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __compute_combined_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __compute_continuum_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __compute_continuum_scattering_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __copy__() (petitRADTRANS.utils.LockedDict method) __dat_opacity_files_warning_message (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) __deepcopy__() (petitRADTRANS.utils.LockedDict method) __default_file_selection() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) __elemental_abundances (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) __get_base_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __get_base_species_mass_fractions() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __get_cia_aliases() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __get_cia_contributors() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __get_condensed_matter_state() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) __get_frequency_grids_intersection_indices() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __get_from_tuple() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) __get_line_opacity_file() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __get_natural_abundance_string() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) __get_non_cia_gas_continuum_contributions() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __get_opacity_sources_dict() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __get_prt2_input_data_subpaths() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) __get_solid_structure() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) __get_species_molar_mass() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) __get_spectral_sampling_type() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) __getattr__() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) __init_clouds_particles_porosity_factor() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) __init_pipeline() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) __init_pipeline_outputs() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) __init_spectral_function() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) __init_velocities() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) __large_figure_font_size (in module petitRADTRANS.plotlib.style) __line_opacity_property_setting_warning_message (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) __medium_figure_font_size (in module petitRADTRANS.plotlib.style) __megabyte (in module petitRADTRANS.__debug) (in module petitRADTRANS.cli.prt_cli) __metals (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) __modify_isotope_string() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity static method) __molar_masses (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) __other_gases_color (in module petitRADTRANS.plotlib.style) __print_missing_data_file_message() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) __print_skipping_message() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) __property_setting_warning_message (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) __recursive_merge_contiguous_isotopes() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) __remove_files() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) __retrieval_parameters_interface() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) __scattering_in_transmission (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) __set_sum_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) __set_use_smart_clear_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) __setitem__() (petitRADTRANS.utils.LockedDict method) __sl (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) __small_figure_font_size (in module petitRADTRANS.plotlib.style) __species_color (in module petitRADTRANS.plotlib.style) __sum_opacities (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) __sysrem_iteration_orders_a() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) __sysrem_iteration_orders_c() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) __tiny_figure_font_size (in module petitRADTRANS.plotlib.style) __use_smart_clear_opacities (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) __version__ (in module petitRADTRANS) _amorphous_structure (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _amorphous_structure_id_pattern (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _anisotropic_cloud_scattering (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) _before_write() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) _build_python_files_hierarchy() (in module petitRADTRANS.__setup_meson_build) _calculate_flux() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) _calculate_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) _calculate_transit_radii() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) _charge_chars (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _charge_pattern (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _charge_separator (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _charge_symbols (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _charges (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _check_data_model_rules() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf) _check_errors() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) _check_spectrum_wavelengths_rules() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf) _chemical_table_dat2h5() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _cias_loaded_opacities (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) _clean_input_data_mac_junk_files() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _clouds_loaded_opacities (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) _colliding_species_separator (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _combine_ck_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _combine_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_cia_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_ck_flux() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_cloud_log_normal_particles_distribution_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_cloud_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_cloud_opacities_using_particle_size_grid() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_feautrier_radiative_transfer() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_gravity() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) _compute_h_minus_bound_free_xsec() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_h_minus_free_free_xsec() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_h_minus_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_h_ratios() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) _compute_non_cia_gas_induced_continuum_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_optical_depths() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_optical_depths_with_photospheric_cloud() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_optical_depths_wrapper() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_planet_star_centers_distance() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) _compute_power_law_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_radius_hydrostatic_equilibrium() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_rayleigh_scattering_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_relative_velocities_wrap() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) _compute_rosseland_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_species_optical_depths() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_transit_fractional_light_loss_uniform() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) _compute_transit_radii() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_transmission_spectrum_contribution() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _compute_z_ratios() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) _condensed_matter_states (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _config_file (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser attribute) _constant_delta_wavelength (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _constant_delta_wavenumber (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _constant_resolving_power (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _continuum_cia_dat2h5() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _continuum_clouds_opacities_dat2h5() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _convert_nasa_exoplanet_archive() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) _convolve_constant() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) _convolve_running() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) _convolve_wrap() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) _corner_wrap() (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) _correlated_k_opacities_dat2h5() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _correlated_k_opacities_dat2h5_external_species() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _crystalline_structure (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _data_are_valid() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) _default_category (petitRADTRANS.opacities.CIAOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.CloudOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.LineByLineOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CIAOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CloudOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.LineByLineOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _default_cia_resolving_power (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _default_cloud_resolving_power (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _default_config (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser attribute) _default_correlated_k_resolving_power (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _default_extension (petitRADTRANS.opacities.CIAOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.CloudOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.LineByLineOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CIAOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CloudOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.LineByLineOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _default_file_names (petitRADTRANS.opacities.CloudOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CloudOpacity attribute) _default_line_by_line_resolving_power (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _default_rebinning_wavelength_range (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity attribute) _default_resolving_power (petitRADTRANS.opacities.CIAOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.CloudOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.LineByLineOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CIAOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CloudOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.LineByLineOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _default_wavelength_range (petitRADTRANS.opacities.CIAOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.CloudOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.LineByLineOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CIAOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CloudOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity attribute) (petitRADTRANS.opacities.opacities.LineByLineOpacity attribute) _directory (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser attribute) _emission_angle_grid (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) _error_check_model_function() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) _explained_error() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) _extension_opacity (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _fixed_model_parameters (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel attribute) _frequency_grid_misalignment_tolerance (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) _gas_matter_state (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _get_base_cia_names() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _get_base_cloud_names() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _get_base_correlated_k_names() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _get_base_line_by_line_names() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _get_default_rebinning_wavelength_range() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _get_default_rebinning_wavenumber_grid() (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity class method) _get_directories_dict() (in module petitRADTRANS.__setup_meson_build) _get_html() (in module petitRADTRANS.cli.prt_cli) _get_input_data_file_not_found_error_message() (in module petitRADTRANS._input_data) _get_input_file() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _get_input_file_from_keeper() (in module petitRADTRANS._input_data) (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _get_model_functions_map() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) _get_parameter_range() (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) _get_prt2_cia_names() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _get_prt2_cloud_names() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _get_prt2_correlated_k_names() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _get_prt2_line_by_line_names() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _get_spectral_information() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _get_spectral_modification_functions_map() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) _get_spectral_parameters() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) _get_sub_path() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity static method) _handle_grid_misalignment() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _has_isotope() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity static method) _init_cia_loaded_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _init_frequency_grid() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) _init_frequency_grid_from_frequency_grid() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _init_frequency_grid_from_lines() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) _init_species_name_elements() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) _instance (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser attribute) _integrate_cloud_opacities_from_dn_dr() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _interpolate_cia() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _interpolate_species_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) _isotope_pattern (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _isotope_separator (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _join_spectral_information() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) _line_by_line_opacities_dat2h5() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _line_by_line_opacity_sampling (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) _line_opacity_mode (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) _lines_loaded_opacities (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) _liquid_matter_state (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _loaded (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable attribute) (petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix.PhoenixStarTable attribute) _locked (petitRADTRANS.utils.LockedDict attribute) _make() (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser class method) _match_function() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) _matter_states (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _merge_contiguous_isotopes() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) _minus_char (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _minus_symbol (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _name_pattern (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _natural_abundance_string (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _path2keeper_url() (in module petitRADTRANS.cli.prt_cli) _path_input_data (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) _phoenix_spec_dat2h5() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _plot_defaults() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) _plus_char (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _plus_symbol (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _prepare_multiple_retrievals_plot() (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) _pressures (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) _rebin_opacities() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) _rebin_wrap() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) _rebuild_isotope_numbers() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _refactor_input_data_folder() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _reporthook() (in module petitRADTRANS.cli.prt_cli) _reporthook_sys_output() (in module petitRADTRANS.cli.prt_cli) _run_ultranest() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) _scattering_in_emission (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans attribute) _select_best_in_column() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) _setup_pres() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) _solar_elemental_abundances (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) _solid_matter_state (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _solid_structure_separator (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _solid_structures (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _sort_pressure_temperature_grid() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) _source_separator (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _space_group_pattern (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _spectral_information_separator (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _spectral_sampling_pattern (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _spectral_sampling_types (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _split_cloud_info() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _split_species_charge() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _split_species_cloud_info() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _split_species_source() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _split_species_spectral_info() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) _temperature_grid_types (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _unclear_structure (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _wavelength_range_pattern (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _wavelength_range_separator (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _wavelength_separator (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) _wavelength_units (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) A a_b_range() (in module petitRADTRANS.retrieval.utils) absolute_path (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) abundance_curvature_prior() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) add_blackbody_cpd_model() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) add_cloud_species() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) add_data() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) add_line_species() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) add_parameter() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) add_photometry() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) add_pressure_varying_line_species() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) amr (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) amu (in module petitRADTRANS.physical_constants) analyzer (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) anisotropic_cloud_scattering (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) argument_of_periastron (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) argument_of_periastron_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) argument_of_periastron_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) atm (in module petitRADTRANS.physical_constants) atmospheric_column_flux_mixer (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) au (in module petitRADTRANS.physical_constants) B b_range() (in module petitRADTRANS.retrieval.utils) bar (in module petitRADTRANS.physical_constants) bayes_factor2sigma() (in module petitRADTRANS.math) best_fit_parameters (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) best_fit_spectra (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) bias_pipeline_metric() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) bin_species_exok() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) bjd_utc2bjd_tdb() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) bond_albedo (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) bond_albedo_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) bond_albedo_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) box_car_conv() (in module petitRADTRANS.math) build_and_lock() (petitRADTRANS.utils.LockedDict class method) build_param_dict() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) bval (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) C c (in module petitRADTRANS.physical_constants) calculate_airmass() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_barycentric_velocities() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_chi2() (in module petitRADTRANS.math) calculate_co_added_ccf_snr() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf) calculate_contribution_spectra() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) calculate_emission_spectrum() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) calculate_equilibrium_temperature() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_flux() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) calculate_forward_model() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) calculate_full_transit_duration() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_impact_parameter() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_intrinsic_temperature() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_intrinsic_temperature_inflated() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_intrinsic_temperature_leconte() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_mid_transit_time() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_optimal_wavelength_boundaries() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) calculate_orbital_longitudes() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_orbital_phases() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_orbital_velocity() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_photosphere_radius() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) calculate_radial_velocity() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_radial_velocity_semi_amplitude() (petitRADTRANS.planet.Planet method) calculate_reduced_chi2() (in module petitRADTRANS.math) calculate_rosseland_planck_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) calculate_spectral_parameters() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) calculate_spectrum() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) calculate_transit_radii() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) calculate_transmission_spectrum() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) calculate_uncertainty() (in module petitRADTRANS.math) call_etc() (in module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli) category (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) ccf_analysis() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf) charge (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) check_all_close() (in module petitRADTRANS.utils) check_name() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) check_opacity_name() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) chi2 (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) CIAOpacity (class in petitRADTRANS.opacities) (class in petitRADTRANS.opacities.opacities) cias_loaded_opacities (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) class2hdf5() (in module petitRADTRANS.utils) class_init_args2class_args() (in module petitRADTRANS.utils) class_init_args2dict() (in module petitRADTRANS.utils) cloud_dict() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) cloud_species (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) CloudOpacity (class in petitRADTRANS.opacities) (class in petitRADTRANS.opacities.opacities) clouds_loaded_opacities (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) co_add_cross_correlation() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf_core) co_ratios (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable attribute) collapse() (in module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli) comm (in module petitRADTRANS.__file_conversion), [1] (in module petitRADTRANS.opacities.opacities), [1] (in module petitRADTRANS.retrieval.retrieval), [1] (in module petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config), [1] compute_airmass() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_barycentric_velocities() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_bins_edges() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) compute_bins_resolving_power() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_cloud_f_sed() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_cloud_hansen_a() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_cloud_hansen_b() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_cloud_particle_radius_distribution_std() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_cloud_particles_mean_radii() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_cloud_photosphere_median_optical_depth() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_clouds_particles_porosity_factor() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_dist() (in module petitRADTRANS.physics) compute_eddy_diffusion_coefficients() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_effective_temperature() (in module petitRADTRANS.physics) compute_emissivities() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_equilibrium_mass_fractions() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_equilibrium_temperature() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_full_transit_duration() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_gray_opacity() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_haze_factor() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_impact_parameter() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_intrinsic_temperature() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_intrinsic_temperature_inflated() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_intrinsic_temperature_leconte() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_mass_fractions() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_mean_molar_masses() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_mean_molar_masses_from_volume_mixing_ratios() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) compute_metallicity() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_mid_transit_time_from_source() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_opaque_cloud_top_pressure() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_optimal_wavelength_boundaries() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_orbit_semi_major_axis() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_orbital_longitudes() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_orbital_phases() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_orbital_velocity() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_planet_radius() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_power_law_opacity_350nm() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_power_law_opacity_coefficient() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_pressure_hydrostatic_equilibrium() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) compute_pressure_nodes() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) compute_radial_velocities() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_radial_velocity() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) compute_radial_velocity_semi_amplitude() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_reference_gravity() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_reference_pressure() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_reflectances() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_relative_velocities() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_resolving_power() (in module petitRADTRANS.math) compute_scaled_metallicity() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_spectral_parameters() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_spectrum() (petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix.PhoenixStarTable method) compute_star_effective_temperature() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_star_flux() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_star_irradiation_angle() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_star_radius() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_star_spectrum() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) compute_stellar_intensities() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_temperatures() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_transit_duration() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_transit_fractional_light_loss() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) compute_velocity_range() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) concatenate_flux_epochs_variability (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) config_file (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser property) configuration (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) confirmation_status (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) constant_efficiency_mode (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) continuum_clouds_opacities_dat2h5() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) continuum_clouds_opacities_dat2h5_external_species() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) continuum_opacities (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) contour_corner() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) convert_all() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) convolve() (in module petitRADTRANS.math) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) convolve_and_sample_variable_resolution_breads() (in module petitRADTRANS.math) corner_files (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) corner_label (petitRADTRANS.retrieval.parameter.Parameter attribute) corner_ranges (petitRADTRANS.retrieval.parameter.Parameter attribute) corner_transform (petitRADTRANS.retrieval.parameter.Parameter attribute) CorrelatedKOpacity (class in petitRADTRANS.opacities) (class in petitRADTRANS.opacities.opacities) covariance (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) cross_correlate() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf_core) cross_correlate_data_model() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf) cross_correlate_matrices() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf_core) cubic_spline_profile() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) (in module petitRADTRANS.physics) D Data (class in petitRADTRANS.retrieval.data) data (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) data_resolution (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) data_resolution_array_model (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) dataset2obj() (in module petitRADTRANS.utils) dec (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) default_color (in module petitRADTRANS.plotlib.style) default_config (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser property) default_file_selection() (in module petitRADTRANS._input_data) define_abundance_node_list() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) define_pressure_node_list() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) delta_prior() (in module petitRADTRANS.retrieval.utils) density (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) density_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) density_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) dict2hdf5() (in module petitRADTRANS.utils) directory (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser property) discovery_method (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) discovery_reference (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) discovery_year (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) dll_directories (in module petitRADTRANS) doppler_shift() (in module petitRADTRANS.physics) download_from_nasa_exoplanet_archive() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) download_input_data() (in module petitRADTRANS.cli.prt_cli) download_planet_from_nasa_exoplanet_archive() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) download_snr_data() (in module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli) dtdp_temperature_profile() (in module petitRADTRANS.physics) E e (in module petitRADTRANS.physical_constants) e_molar_mass (in module petitRADTRANS.physical_constants) element_number2element_symbol() (in module petitRADTRANS.chemistry.prt_molmass) element_symbol2element_number() (in module petitRADTRANS.chemistry.prt_molmass) emission_angle_grid (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) emission_model_diseq() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) emission_model_diseq_patchy_clouds() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) emission_model_diseq_simple_patchy_clouds() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) epoch_of_periastron (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) epoch_of_periastron_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) epoch_of_periastron_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) equilibrium_temperature (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) equilibrium_temperature_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) equilibrium_temperature_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) evaluate_sample_spectra (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) exo_k_multiple_rebin() (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity class method) exo_k_multiple_rebin_from_species() (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity class method) exo_k_rebin() (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity class method) extension (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) external_radtrans_reference (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) F fair_share() (in module petitRADTRANS.slurm_runs.utils) feature_scaling() (in module petitRADTRANS.math) file_name (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) fill_atmosphere() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) fill_atmospheric_layer() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) fill_object() (in module petitRADTRANS.utils) filter_spectrum_with_spline() (in module petitRADTRANS.math) find() (petitRADTRANS.opacities.CIAOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.CloudOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CIAOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CloudOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) find_input_file() (in module petitRADTRANS._input_data) find_optimal_airmass_day() (in module petitRADTRANS.cli.eso_skycalc_cli) find_spectral_information() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) fits_output() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) fixed_length_amr() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) flatten_object() (in module petitRADTRANS.utils) flux2irradiance() (in module petitRADTRANS.physics) flux_cm2flux_hz() (in module petitRADTRANS.physics) flux_grid (petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix.PhoenixStarTable attribute) flux_hz2flux_cm() (in module petitRADTRANS.physics) flux_units (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.style) fluxes (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel attribute) format2petitradtrans() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) frequencies (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) frequency2wavelength() (in module petitRADTRANS.physics) frequency_bins_edges (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) from_data() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval class method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval class method) from_dict() (petitRADTRANS.retrieval.parameter.RetrievalParameter class method) from_radtrans() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel class method) from_retrieval() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel class method) from_species() (petitRADTRANS.opacities.CIAOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.CloudOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.LineByLineOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CIAOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CloudOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.LineByLineOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) from_species_fullname() (petitRADTRANS.opacities.CIAOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.CloudOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.LineByLineOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CIAOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CloudOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.LineByLineOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) from_tab_file() (petitRADTRANS.planet.Planet class method) from_votable() (petitRADTRANS.planet.Planet class method) from_votable_file() (petitRADTRANS.planet.Planet class method) full_extension (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) G G (in module petitRADTRANS.physical_constants) gas_continuum_contributors (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) gaussian_prior() (in module petitRADTRANS.retrieval.utils) gaussian_weights1d() (in module petitRADTRANS.math) gaussian_weights_running() (in module petitRADTRANS.math) generate_filename() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) generate_mock_data (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) generate_retrieval_summary() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get() (petitRADTRANS.planet.Planet class method) get_absolute_path() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) get_abundances() (in module petitRADTRANS.chemistry.core) get_airmass() (in module petitRADTRANS.cli.eso_skycalc_cli) get_aliases() (petitRADTRANS.opacities.CloudOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CloudOpacity class method) get_analyzer() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_astropy_coordinates() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) get_base_figure_name() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_base_name() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) get_best_fit_chi2() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_best_fit_likelihood() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval static method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval static method) get_best_fit_model() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_best_fit_parameters() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_bhans() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) get_calculate_flux_return_values() (in module petitRADTRANS.retrieval.utils) get_ccf_model_wavelengths() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf) get_ccf_models() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf) get_ccf_velocity_space() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf) get_charge_string() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) get_chi2() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_chi2_normalisation() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_chisq() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data method) get_cia_aliases() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_cia_opacity_file_extension() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_cloud_aliases() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_cloud_info() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) get_cloud_opacity_file_extension() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_co_added_ccf_peak_properties() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf) get_co_added_ccf_velocity_space() (in module petitRADTRANS.ccf.ccf) get_correlated_k_opacity_file_extension() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_data() (in module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli) get_data_model() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_default_category() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) get_default_cloud_resolution() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_default_correlated_k_resolution() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_default_directory() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) get_default_extension() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) get_default_file() (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable static method) (petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix.PhoenixStarTable static method) get_default_line_by_line_resolution() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_default_parameters() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) get_default_resolving_power() (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) get_directory() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) get_easychem_abundances() (in module petitRADTRANS.chemistry.prt_easychem) get_elpd_per_datapoint() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_etc_url() (in module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli) get_evidence() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_exoatmos_abundances (in module petitRADTRANS.chemistry.core) get_exoatmos_abundances() (in module petitRADTRANS.chemistry.prt_easychem) get_file_name() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) get_file_name_elements() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) get_filename() (petitRADTRANS.planet.Planet method) get_flattened_value() (petitRADTRANS.retrieval.parameter.Parameter method) get_from() (petitRADTRANS.planet.Planet class method) get_fseds() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) get_full_extension() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) get_full_name() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) get_full_range_model() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_input_data_file_not_found_error_message() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_input_data_path() (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser method) get_input_data_subpath() (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser method) get_input_data_subpaths() (in module petitRADTRANS.config.configuration) get_input_file() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_isotopologue_name() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) get_keeper_files_url_paths() (in module petitRADTRANS.cli.prt_cli) get_line_by_line_opacity_file_extension() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_line_separator() (in module petitRADTRANS.slurm_runs.sbatch) get_log_likelihood() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data method) get_log_likelihood_per_datapoint() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_mass_fractions() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_max_likelihood_params() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_median_params() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_model_functions() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) get_model_parameters() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) get_molmass_name() (in module petitRADTRANS.chemistry.prt_molmass) get_opacity_directory() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_opacity_filename() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) get_opacity_input_file() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_optimal_airmass_curve() (in module petitRADTRANS.cli.eso_skycalc_cli) get_param_uniform() (petitRADTRANS.retrieval.parameter.Parameter method) get_parameters_prior_mid_range_values() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_pymultinest_sample_dict() (in module petitRADTRANS.retrieval.utils) get_quantile_parameters() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_reduced_chi2() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_reduced_chi2_from_model() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_resolving_power_from_string() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) get_resolving_power_string() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) get_samples() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_samples_dict() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) get_snr_data_file_name() (in module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli) get_solar_elemental_abundances() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) get_special_parameters() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval static method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval static method) get_species_base_name() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) get_species_basename() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) get_species_color() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.style) get_species_directory() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) get_species_elements() (in module petitRADTRANS.chemistry.prt_molmass) get_species_isotopologue_name() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) get_species_molar_mass() (in module petitRADTRANS.chemistry.prt_molmass) get_species_scientific_name() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) get_spectral_info() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) get_telluric_data() (in module petitRADTRANS.cli.eso_skycalc_cli) get_telluric_transmittances() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) get_tellurics_npz() (in module petitRADTRANS.cli.eso_skycalc_cli) get_true_parameters() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) get_volume_mixing_ratios() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) get_wavelengths() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) gpdfitnew() (in module petitRADTRANS.retrieval.psis) gpinv() (in module petitRADTRANS.retrieval.psis) gradient_profile_emission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) guillot_emission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) guillot_emission_add_gaussian_temperature() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) guillot_patchy_emission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) guillot_patchy_transmission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) guillot_transmission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) H h (in module petitRADTRANS.physical_constants) has_colliding_species (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity property) hdf52dict() (in module petitRADTRANS.utils) host_name (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) hz2um() (in module petitRADTRANS.physics) I init_data() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) init_default() (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser class method) init_meson_build() (in module petitRADTRANS.__setup_meson_build) init_retrieval() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) initialise_data_resolution() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data method) initialize_pressure() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) insolation_flux (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) insolation_flux_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) insolation_flux_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) instruments (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) interpolate_mass_fractions() (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable method) interpolated_profile_emission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) intersection_indices() (in module petitRADTRANS.utils) inv_cov (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) inverse_gamma_prior() (in module petitRADTRANS.retrieval.utils) is_free_parameter (petitRADTRANS.retrieval.parameter.Parameter attribute) isothermal_transmission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) J join_species_all_info() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) K kB (in module petitRADTRANS.physical_constants) L L0 (in module petitRADTRANS.physical_constants) l_sun (in module petitRADTRANS.physical_constants) light_year (in module petitRADTRANS.physical_constants) line_b_uncertainty_scaling() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data method) line_by_line_opacities_dat2h5() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) line_by_line_opacity_sampling (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) line_opacity_mode (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) line_species (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) linear_spline_interpolation() (in module petitRADTRANS.math) linear_spline_profile() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) (in module petitRADTRANS.physics) LineByLineOpacity (class in petitRADTRANS.opacities) (class in petitRADTRANS.opacities.opacities) lines_loaded_opacities (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) list_available_cia_species() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig static method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig static method) list_available_cloud_species() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig static method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig static method) list_available_line_species() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig static method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig static method) list_str2str() (in module petitRADTRANS.utils) load() (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable method) (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) (petitRADTRANS.planet.Planet class method) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel class method) (petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix.PhoenixStarTable method) load_all_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) load_cia_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) load_cia_opacity() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) load_cloud_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) load_cloud_opacity() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) load_csv() (in module petitRADTRANS.utils) load_dace() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) load_dat() (in module petitRADTRANS.slurm_runs.utils) load_exocross() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) load_hdf5_ktables() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans class method) load_hdf5_line_opacity_table() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) load_jwst() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data method) load_line_opacities() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans method) load_line_opacities_pressure_temperature_grid() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) load_mpi (in module petitRADTRANS.__file_conversion), [1] (in module petitRADTRANS.retrieval.retrieval), [1] loadfits() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data method) loadtxt() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data method) lock() (petitRADTRANS.utils.LockedDict method) LockedDict (class in petitRADTRANS.utils) log10_effective_temperature_grid (petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix.PhoenixStarTable attribute) log10_metallicities (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable attribute) log_covariance_determinant (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) log_gaussian_prior() (in module petitRADTRANS.retrieval.utils) log_likelihood() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data static method) (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) log_likelihood2chi2() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data static method) log_prior() (in module petitRADTRANS.retrieval.utils) longitude2phase() (in module petitRADTRANS.math) M m_earth (in module petitRADTRANS.physical_constants) m_elec (in module petitRADTRANS.physical_constants) m_jup (in module petitRADTRANS.physical_constants) m_sun (in module petitRADTRANS.physical_constants) madhu_seager_2009() (in module petitRADTRANS.physics) madhu_seager_patchy_transmission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) madhushudhan_seager_emission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) madhushudhan_seager_transmission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) make_press_temp() (in module petitRADTRANS.physics) make_press_temp_iso() (in module petitRADTRANS.physics) make_srun_script_from_template() (in module petitRADTRANS.slurm_runs.sbatch) malloc_peak_snapshot() (in module petitRADTRANS.__debug) malloc_top_lines_snapshot() (in module petitRADTRANS.__debug) mask (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) mass (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) mass2reference_gravity() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) mass_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) mass_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) mass_fractions (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable attribute) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel attribute) mass_fractions2metallicity() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) mass_fractions2volume_mixing_ratios() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) match_function_default() (in module petitRADTRANS._input_data) matter_state (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) mean_molar_masses (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable attribute) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel attribute) mean_uncertainty() (in module petitRADTRANS.math) median_uncertainties() (in module petitRADTRANS.math) model_functions_map (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel attribute) model_generating_function (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) model_parameters (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel attribute) model_resolution (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) modify_isotope_numbers() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) modify_spectrum() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) module petitRADTRANS petitRADTRANS.__debug petitRADTRANS.__file_conversion petitRADTRANS.__setup_meson_build petitRADTRANS._input_data petitRADTRANS._input_data_loader petitRADTRANS.ccf petitRADTRANS.ccf.ccf petitRADTRANS.ccf.ccf_core petitRADTRANS.chemistry petitRADTRANS.chemistry.clouds petitRADTRANS.chemistry.core petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry petitRADTRANS.chemistry.prt_easychem petitRADTRANS.chemistry.prt_molmass petitRADTRANS.chemistry.utils petitRADTRANS.cli petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli petitRADTRANS.cli.eso_skycalc_cli petitRADTRANS.cli.prt_cli petitRADTRANS.config petitRADTRANS.config.configuration petitRADTRANS.math petitRADTRANS.opacities petitRADTRANS.opacities.opacities petitRADTRANS.physical_constants petitRADTRANS.physics petitRADTRANS.planet petitRADTRANS.plotlib petitRADTRANS.plotlib.plotlib petitRADTRANS.plotlib.style petitRADTRANS.radtrans petitRADTRANS.retrieval petitRADTRANS.retrieval.data petitRADTRANS.retrieval.models petitRADTRANS.retrieval.parameter petitRADTRANS.retrieval.preparing petitRADTRANS.retrieval.psis petitRADTRANS.retrieval.retrieval petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config petitRADTRANS.retrieval.utils petitRADTRANS.slurm_runs petitRADTRANS.slurm_runs.sbatch petitRADTRANS.slurm_runs.utils petitRADTRANS.spectral_model petitRADTRANS.stellar_spectra petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix petitRADTRANS.utils module_dir (in module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli) MPI (in module petitRADTRANS.__file_conversion) (in module petitRADTRANS.retrieval.retrieval) N n_live_points (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) nA (in module petitRADTRANS.physical_constants) nabla_adiabatic (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable attribute) name (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) (petitRADTRANS.retrieval.parameter.Parameter attribute) (petitRADTRANS.retrieval.parameter.RetrievalParameter attribute) natural_abundance (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) nice_corner() (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) normalize() (in module petitRADTRANS.math) O offset (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) offset_bool (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) Opacity (class in petitRADTRANS.opacities.opacities) orbit_semi_major_axis (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) orbit_semi_major_axis_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) orbit_semi_major_axis_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) orbital_eccentricity (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) orbital_eccentricity_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) orbital_eccentricity_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) orbital_inclination (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) orbital_inclination_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) orbital_inclination_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) orbital_period (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) orbital_period_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) orbital_period_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) output() (in module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli) output_directory (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) P param_dictionary (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) Parameter (class in petitRADTRANS.retrieval.parameter) parameters (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) path (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) path_input_data (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) path_to_observations (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) pc (in module petitRADTRANS.physical_constants) petitRADTRANS module petitRADTRANS.__debug module petitRADTRANS.__file_conversion module petitRADTRANS.__setup_meson_build module petitRADTRANS._input_data module petitRADTRANS._input_data_loader module petitRADTRANS.ccf module petitRADTRANS.ccf.ccf module petitRADTRANS.ccf.ccf_core module petitRADTRANS.chemistry module petitRADTRANS.chemistry.clouds module petitRADTRANS.chemistry.core module petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry module petitRADTRANS.chemistry.prt_easychem module petitRADTRANS.chemistry.prt_molmass module petitRADTRANS.chemistry.utils module petitRADTRANS.cli module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli module petitRADTRANS.cli.eso_skycalc_cli module petitRADTRANS.cli.prt_cli module petitRADTRANS.config module petitRADTRANS.config.configuration module petitRADTRANS.math module petitRADTRANS.opacities module petitRADTRANS.opacities.opacities module petitRADTRANS.physical_constants module petitRADTRANS.physics module petitRADTRANS.planet module petitRADTRANS.plotlib module petitRADTRANS.plotlib.plotlib module petitRADTRANS.plotlib.style module petitRADTRANS.radtrans module petitRADTRANS.retrieval module petitRADTRANS.retrieval.data module petitRADTRANS.retrieval.models module petitRADTRANS.retrieval.parameter module petitRADTRANS.retrieval.preparing module petitRADTRANS.retrieval.psis module petitRADTRANS.retrieval.retrieval module petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config module petitRADTRANS.retrieval.utils module petitRADTRANS.slurm_runs module petitRADTRANS.slurm_runs.sbatch module petitRADTRANS.slurm_runs.utils module petitRADTRANS.spectral_model module petitRADTRANS.stellar_spectra module petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix module petitRADTRANS.utils module petitradtrans_config_parser (in module petitRADTRANS.config) (in module petitRADTRANS.config.configuration) PetitradtransConfigParser (class in petitRADTRANS.config.configuration) PGLOBAL (in module petitRADTRANS.retrieval.models) pglobal_check() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) phase2longitude() (in module petitRADTRANS.math) phoenix_star_table (in module petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix) PhoenixStarTable (class in petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix) photometric_bin_edges (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) photometric_transformation_function (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) photometry (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) photometry_range (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) planck_function_cm() (in module petitRADTRANS.physics) planck_function_hz() (in module petitRADTRANS.physics) planck_function_hz_temperature_derivative() (in module petitRADTRANS.physics) Planet (class in petitRADTRANS.planet) planet_stellar_radius_ratio (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) planet_stellar_radius_ratio_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) planet_stellar_radius_ratio_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) plot_abundances() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) plot_all() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) plot_cloud_condensation_curves() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) plot_contribution() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) plot_corner() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) plot_data() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) plot_in_corner (petitRADTRANS.retrieval.parameter.Parameter attribute) plot_kwargs (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) plot_multiple_posteriors() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) plot_opacity_contributions() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) plot_planet_context() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) plot_posterior() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) plot_pt() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) plot_radtrans_opacities() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) plot_result_corner() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.plotlib) plot_sampled() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) plot_spectra() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) polyfit() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) posterior_sample_spectra (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) power_law_profile_emission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) power_law_profile_transmission() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) power_law_temperature_profile() (in module petitRADTRANS.physics) power_load() (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser method) power_set() (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser method) power_update() (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser method) pre_calculated_equilibrium_chemistry_table (in module petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry) PreCalculatedEquilibriumChemistryTable (class in petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry) preparing_pipeline() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) pressures (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable attribute) (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) print_log_likelihood_for_debugging (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) prior() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) prior_function (petitRADTRANS.retrieval.parameter.RetrievalParameter attribute) prior_parameters (petitRADTRANS.retrieval.parameter.RetrievalParameter attribute) prior_type (petitRADTRANS.retrieval.parameter.RetrievalParameter attribute) prior_ultranest() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) projected_obliquity (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) projected_obliquity_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) projected_obliquity_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) prt_emcee_mode (in module petitRADTRANS.__file_conversion) (in module petitRADTRANS.retrieval.retrieval) prt_plot_style (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) prt_resolving_space() (in module petitRADTRANS.math) psisloo() (in module petitRADTRANS.retrieval.psis) psislw() (in module petitRADTRANS.retrieval.psis) pt_plot_mode (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) put_into_dict() (petitRADTRANS.retrieval.parameter.RetrievalParameter method) R R (in module petitRADTRANS.physical_constants) r_earth (in module petitRADTRANS.physical_constants) r_jup (in module petitRADTRANS.physical_constants) r_jup_mean (in module petitRADTRANS.physical_constants) r_sun (in module petitRADTRANS.physical_constants) ra (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) radial_velocity_semi_amplitude (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) radial_velocity_semi_amplitude_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) radial_velocity_semi_amplitude_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) radius (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) radius_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) radius_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) radius_grid (petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix.PhoenixStarTable attribute) Radtrans (class in petitRADTRANS.radtrans) radtrans_grid (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) radtrans_object (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) rank (in module petitRADTRANS.__file_conversion) (in module petitRADTRANS.opacities.opacities) (in module petitRADTRANS.retrieval.retrieval) (in module petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config) rayleigh_species (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) rebin_ck_line_opacities() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) rebin_multiple_ck_line_opacities() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) rebin_spectrum() (in module petitRADTRANS.physics) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) rebin_spectrum_bin() (in module petitRADTRANS.physics) rebin_star_spectrum() (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans static method) reference (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) reference_gravity (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) reference_gravity2mass() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) reference_gravity2radius() (petitRADTRANS.planet.Planet static method) reference_gravity_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) reference_gravity_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) reference_pressure (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) remove_mask() (in module petitRADTRANS.utils) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) remove_noisy_wavelength_channels() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) remove_species_lines() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) remove_telluric_lines_fit() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) remove_telluric_lines_mean() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) remove_throughput_fit() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) remove_throughput_mean() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) repair() (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser method) request_file (in module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli) request_file_base_dict (in module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli) resample (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) resolving_power_str (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) resolving_space() (in module petitRADTRANS.math) resume (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) Retrieval (class in petitRADTRANS.retrieval) (class in petitRADTRANS.retrieval.retrieval) retrieval_model_generating_function() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) retrieval_name (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) RetrievalConfig (class in petitRADTRANS.retrieval) (class in petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config) RetrievalParameter (class in petitRADTRANS.retrieval.parameter) return_cloud_mass_fraction() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_fe() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_fe_comb() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_fe_comb_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_fe_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_fe_l() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_fe_l_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_kcl() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_kcl_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_mg2sio4() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_mg2sio4_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_mgsio3() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_mgsio3_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_na2s() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_na2s_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_sio() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_t_cond_sio_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_x_fe() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_x_kcl() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_x_mg2sio4() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_x_mgfesio4() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_x_mgsio3() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_x_na2s() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) return_x_sio() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) run() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) run_mode (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) run_retrieval() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) running_mean() (in module petitRADTRANS.math) S s_earth (in module petitRADTRANS.physical_constants) sample_teff() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) samples (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) sampling_efficiency (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) save() (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity method) (petitRADTRANS.planet.Planet method) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) save_best_fit_outputs() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) save_best_fit_outputs_external_variability() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) save_configuration() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) save_mass_fractions() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) save_parameters() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) save_volume_mixing_ratios() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) savez_compressed_record() (in module petitRADTRANS.utils) scale (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) scale_err (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) scale_factor (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) scale_spectrum() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) scale_to_distance() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data method) scattering_in_emission (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig attribute) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig attribute) select_default_file() (in module petitRADTRANS._input_data) semi_major_axis_stellar_radius_ratio (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) semi_major_axis_stellar_radius_ratio_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) semi_major_axis_stellar_radius_ratio_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) set_continuum_opacities() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) set_default_file() (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser method) set_distance() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data method) set_input_data_path() (petitRADTRANS.config.configuration.PetitradtransConfigParser method) set_line_species() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) set_param() (petitRADTRANS.retrieval.parameter.Parameter method) set_petitradtrans_plot_style() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.style) set_pglobal() (in module petitRADTRANS.retrieval.models) set_rayleigh_species() (petitRADTRANS.retrieval.retrieval_config.RetrievalConfig method) (petitRADTRANS.retrieval.RetrievalConfig method) setup_clouds() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) setup_data() (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval method) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval method) setup_exoatmos() (in module petitRADTRANS.chemistry.prt_easychem) setup_simple_clouds_hazes() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) shift_wavelengths() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel static method) sigma (in module petitRADTRANS.physical_constants) sigma2bayes_factor() (in module petitRADTRANS.math) simple_cdf() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_fe() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_fe_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_kcl() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_kcl_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_mg2sio4() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_mg2sio4_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_mgsio3() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_mgsio3_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_na2s() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_na2s_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_sio() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simple_cdf_sio_free() (in module petitRADTRANS.chemistry.clouds) simplify_species_list() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) solid_structure (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) solid_structure_id (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) source (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) species (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable attribute) species_base_name (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) species_cloud_info (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) species_full_name (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) species_isotopologue_name (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) species_list (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) spectral_modification_functions_map (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel attribute) spectral_sampling (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) spectral_sampling_type (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) SpectralModel (class in petitRADTRANS.spectral_model) spectrum (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) split_cloud_info() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) split_input_data_path() (in module petitRADTRANS._input_data) (in module petitRADTRANS._input_data_loader) split_species_all_info() (in module petitRADTRANS._input_data_loader) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) split_species_charge() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) split_species_cloud_info() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity static method) split_species_source() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) split_species_spectral_info() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) split_spectral_info() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) split_spectral_sampling_info() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) split_wavelength_range_info() (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity class method) SQRT2 (in module petitRADTRANS.retrieval.utils) star_age (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_age_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_age_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_density (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_density_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_density_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_effective_temperature (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_effective_temperature_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_effective_temperature_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_luminosity (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_luminosity_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_luminosity_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_mass (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_mass_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_mass_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_metallicity (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_metallicity_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_metallicity_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_radial_velocity (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_radial_velocity_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_radial_velocity_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_radius (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_radius_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_radius_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_reference (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_reference_gravity (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_reference_gravity_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_reference_gravity_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_rotational_period (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_rotational_period_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_rotational_period_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_rotational_velocity (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_rotational_velocity_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_rotational_velocity_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) star_spectral_type (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) stepped_profile() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) sub_path (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) subtract_continuum (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) sumlogs() (in module petitRADTRANS.retrieval.psis) sysrem() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) system_apparent_magnitude_j (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_apparent_magnitude_j_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_apparent_magnitude_j_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_apparent_magnitude_k (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_apparent_magnitude_k_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_apparent_magnitude_k_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_apparent_magnitude_v (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_apparent_magnitude_v_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_apparent_magnitude_v_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_distance (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) system_distance_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_distance_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_moon_number (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_planet_number (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_proper_motion (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_proper_motion_dec (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_proper_motion_dec_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_proper_motion_dec_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_proper_motion_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_proper_motion_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_proper_motion_ra (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_proper_motion_ra_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_proper_motion_ra_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) system_star_number (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) T temperature_curvature_prior() (in module petitRADTRANS.physics) temperature_profile_function_guillot() (in module petitRADTRANS.physics) temperature_profile_function_guillot_dayside() (in module petitRADTRANS.physics) temperature_profile_function_guillot_global() (in module petitRADTRANS.physics) temperature_profile_function_guillot_global_ret() (in module petitRADTRANS.physics) temperature_profile_function_guillot_metallic() (in module petitRADTRANS.physics) temperature_profile_function_guillot_modif() (in module petitRADTRANS.physics) temperature_profile_function_isothermal() (in module petitRADTRANS.physics) temperature_profile_function_ret_model() (in module petitRADTRANS.physics) temperatures (petitRADTRANS.chemistry.pre_calculated_chemistry.PreCalculatedEquilibriumChemistryTable attribute) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel attribute) test_plotting (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) topological_sort() (in module petitRADTRANS.utils) transform_prior_cube_coordinate (petitRADTRANS.retrieval.parameter.Parameter attribute) transit_depth (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) transit_depth_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) transit_depth_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) transit_duration (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) transit_duration_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) transit_duration_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) transit_midpoint_time (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) transit_midpoint_time_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) transit_midpoint_time_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) transit_radii (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel attribute) trim_spectrum() (in module petitRADTRANS.retrieval.preparing) true_obliquity (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) true_obliquity_error_lower (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) true_obliquity_error_upper (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) U ultranest (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) um2hz() (in module petitRADTRANS.physics) uncertainties (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) uncertainties_mode (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) uniform_prior() (in module petitRADTRANS.retrieval.utils) unlock() (petitRADTRANS.utils.LockedDict method) update() (petitRADTRANS.utils.LockedDict method) update_atom_abundances() (in module petitRADTRANS.chemistry.prt_easychem) update_bins() (petitRADTRANS.retrieval.data.Data method) update_figure_font_size() (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.style) update_model_functions_map() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) update_spectral_calculation_parameters() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel method) use_mpi (petitRADTRANS.retrieval.Retrieval attribute) (petitRADTRANS.retrieval.retrieval.Retrieval attribute) user_input() (in module petitRADTRANS.utils) V value (petitRADTRANS.retrieval.parameter.Parameter attribute) variability_atmospheric_column_model_flux_return_mode (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) volume_mixing_ratios2mass_fractions() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) volume_mixing_ratios2metallicity() (in module petitRADTRANS.chemistry.utils) W wavelength2frequency() (in module petitRADTRANS.physics) wavelength_bin_widths (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) wavelength_boundaries (petitRADTRANS.radtrans.Radtrans property) (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) wavelength_grid (petitRADTRANS.stellar_spectra.phoenix.PhoenixStarTable attribute) wavelength_max (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) wavelength_min (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity attribute) wavelength_units (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.style) wavelengths (petitRADTRANS.retrieval.data.Data attribute) (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel attribute) wavenumber_units (in module petitRADTRANS.plotlib) (in module petitRADTRANS.plotlib.style) with_velocity_range() (petitRADTRANS.spectral_model.SpectralModel class method) write() (petitRADTRANS.opacities.CIAOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.CloudOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.LineByLineOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CIAOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CloudOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.CorrelatedKOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.LineByLineOpacity class method) (petitRADTRANS.opacities.opacities.Opacity static method) write_cia_opacities() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) write_cloud_opacities() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) write_correlated_k() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) write_line_by_line() (in module petitRADTRANS.__file_conversion) write_request_file() (in module petitRADTRANS.cli.eso_etc_cli) X x (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) Y y (petitRADTRANS.planet.Planet attribute) Z z (petitRADTRANS.planet.Planet attribute)
